木叶村遭到神秘忍者集团的偷袭，伤亡惨重。一场可怕的忍界大战即将爆发。

鸣人一行为了解救危机踏上旅途，失踪已久的佐助竟出乎意料地出现在大家面前。佐助为了向兄长鼬复仇而离开故乡，此番回来究竟是敌是友？而神秘忍者集团的真正目的又是什么？